De periode 1945-1969 bestrijkt de dekolonisatie van Indonesië vanaf de capitulatie van Japan in 1945 tot en met de Daad van Vrije Keuze van 1969, die de aansluiting van westelijk Nieuw-Guinea bij de Republiek Indonesia bevestigde. Aan de Nederlands-Indonesische betrekkingen in deze jaren is een aantal op elkaar aansluitende publicaties gewijd: bronnenuitgaven, een onderzoeksgids, een uitvoerig toegelichte bloemlezing van documenten uit het laatste jaar van Nederlands-Indië, congresbundels en een monografie.